Curso de Electroforesis

Clase 1 • Variables clave que afectan la separación

Identifica el voltaje, la temperatura, el pH y la composición de la muestra como parámetros críticos. Los estudiantes aprenden a predecir cómo el cambio de cada variable altera los patrones de migración.

Clase 2 • Desarrollo histórico y aplicaciones

Traza la evolución de la electroforesis desde los primeros estudios de proteínas séricas hasta la genómica moderna. Contextualiza la evolución de la técnica y motiva los capítulos técnicos posteriores.

Clase 3 • Principios de la migración de moléculas cargadas

Abarca la carga iónica, las interacciones con campos eléctricos y los conceptos de carga neta. Conecta la electroquímica fundamental con el porqué del movimiento de las moléculas en una matriz de gel o solución.

Clase 1 • Sistemas de gel especiales y modificados

Introduce los geles en gradiente, los geles desnaturalizantes y la agarosa de bajo punto de fusión. Expande el conjunto de herramientas del estudiante para separaciones complejas que se abordarán en capítulos posteriores.

Clase 2 • Sistemas de amortiguadores y sus funciones

Compara los amortiguadores TAE, TBE, MOPS, Tris-glicina y MES por rango de tamponamiento y fuerza iónica. Los estudiantes adecuan la elección del amortiguador al tipo de analito y las aplicaciones posteriores.

Clase 3 • Química del gel de poliacrilamida

Explica la polimerización de acrilamida y bis-acrilamida, la densidad de entrecruzamiento y la notación %T/%C. Prepara a los estudiantes para formular geles para la separación de proteínas y ácidos nucleicos pequeños.

Clase 1 • Marcadores de peso molecular y escaleras

Explica la composición de las escaleras, la estimación del tamaño de fragmentos y las cantidades de carga adecuadas. La estimación precisa del tamaño depende de la selección correcta del marcador y la ubicación en la calle.

Clase 2 • Solución de problemas comunes en geles

Identifica las causas de barrido, calles distorsionadas, bandas tenues y fluorescencia de fondo. Las habilidades de solución sistemática de problemas se transfieren a todas las técnicas en gel de capítulos posteriores.

Clase 3 • Tinción, visualización y documentación

Compara los métodos de tinción con bromuro de etidio, SYBR Safe y GelRed, y la obtención de imágenes con UV/luz azul. Los estudiantes seleccionan protocolos de tinción seguros y sensibles, y documentan los resultados adecuadamente.

Clase 4 • Preparación de muestras para ácidos nucleicos

Abarca la cuantificación de ADN y ARN, la composición del amortiguador de carga y la desnaturalización para ARN. La preparación adecuada previene el barrido y asegura una migración reproducible.

Clase 1 • Formulación de geles para SDS-PAGE

Abarca la composición del gel concentrador y separador, los porcentajes de acrilamida y las opciones de gradiente. Los estudiantes formulan geles adecuados al rango de peso molecular de sus proteínas de interés.

Clase 2 • Estimación de peso molecular y análisis de bandas

Utiliza escaleras de proteínas y regresión lineal en gráficos semi-logarítmicos para estimar pesos moleculares. Los estudiantes interpretan patrones de bandas para evaluar pureza, degradación y niveles de expresión.

Clase 3 • Ejecución de SDS-PAGE y tinción de proteínas

Guía a los estudiantes a través del ensamblaje, las condiciones de electroforesis y la tinción con Coomassie o plata. La ejecución adecuada produce bandas nítidas y bien resueltas, adecuadas para análisis posteriores.

Clase 4 • Preparación de muestras proteicas

Detalla los métodos de lisis, los ensayos de cuantificación de proteínas y la preparación del amortiguador de muestra. La preparación consistente de la muestra es un prerrequisito para obtener resultados reproducibles en SDS-PAGE.

Clase 1 • Sistemas de detección y generación de señales

Compara los métodos de detección por quimioluminiscencia ECL, fluorescencia y colorimetría. Los estudiantes seleccionan sistemas de detección según los requisitos de sensibilidad y la instrumentación disponible.

Clase 2 • Bloqueo e incubación con anticuerpos

Abarca los agentes de bloqueo, la optimización de la dilución del anticuerpo primario y la selección del anticuerpo secundario. Las condiciones adecuadas de bloqueo y anticuerpos minimizan el fondo y maximizan la especificidad de la señal.

Clase 3 • Transferencia de proteínas a membranas

Compara los sistemas de transferencia húmeda, semi-seca y seca, y las membranas de PVDF vs. nitrocelulosa. La eficiencia de la transferencia determina directamente la sensibilidad de detección en los pasos posteriores.

Clase 4 • Análisis cuantitativo de western blot

Introduce los controles de carga, las estrategias de normalización y el software de densitometría. Los estudiantes producen datos cuantitativos estadísticamente válidos a partir de imágenes de western blot.

Clase 1 • Rehidratación de tiras IPG y protocolo de IEF

Detalla los métodos de carga de muestra, las condiciones de rehidratación y los programas de rampa de voltaje para IEF. La ejecución correcta del protocolo previene el barrido horizontal y asegura un enfoque nítido.

Clase 2 • Principios de la PAGE nativa

Explica la separación por carga, tamaño y forma bajo condiciones no desnaturalizantes. Los estudiantes comprenden cuándo se prefiere la PAGE nativa sobre la SDS-PAGE para estudios funcionales.

Clase 3 • Fundamentos del enfoque isoeléctrico

Explica la formación del gradiente de pH, el enfoque de proteínas en su pI y los sistemas de anfolitos transportadores vs. tiras IPG. El IEF resuelve proteínas que difieren en tan solo 0.01 unidades de pH.

Clase 4 • Electroforesis bidimensional en gel

Combina IEF y SDS-PAGE para resolver miles de proteínas por pI y peso molecular. Los estudiantes ejecutan flujos de trabajo de 2-DE e interpretan patrones complejos de manchas.

Clase 1 • Electroforesis capilar en gel para ácidos nucleicos

Aplica capilares rellenos de polímero para el dimensionamiento de fragmentos de ADN y la evaluación de la calidad del ARN. La ECG reemplaza los geles en placa con análisis automatizado, cuantitativo y de alto rendimiento.

Clase 2 • Electroforesis capilar zonal

Abarca los principios de separación de ECZ, la selección del amortiguador y los modos de inyección para moléculas pequeñas y proteínas. Los estudiantes desarrollan y validan métodos de ECZ para clases definidas de analitos.

Clase 3 • Instrumentación para electroforesis capilar

Describe las dimensiones del capilar, las fuentes de alto voltaje, los detectores y los componentes del automuestreador. La familiaridad con el instrumento es un prerrequisito para el desarrollo de métodos en secciones posteriores.

Clase 4 • Enfoque isoeléctrico capilar

Adapta los principios de IEF al formato capilar para la determinación del pI de proteínas y el perfilado de isoformas. Los estudiantes comparan el cIEF con el IEF en gel en términos de resolución y rendimiento.

Clase 1 • Desarrollo y validación de métodos

Aplica los principios del diseño de experimentos para optimizar el porcentaje de gel, el amortiguador y las condiciones de corrida. Los parámetros de validación incluyen especificidad, linealidad, rango y reproducibilidad.

Clase 2 • Densitometría cuantitativa y análisis de imágenes

Abarca los ajustes de adquisición de imágenes, la sustracción de fondo y el análisis del perfil de calles para una cuantificación precisa. Los estudiantes utilizan herramientas de software para extraer datos numéricos fiables de imágenes de gel.

Clase 3 • Electroforesis en gel de campo pulsado

Explica los principios del campo eléctrico alternante que permiten la separación de ADN de megabases. Los estudiantes aplican PFGE a la tipificación microbiana y al análisis de genomas grandes.

Clase 4 • Integración con métodos analíticos posteriores

Conecta los resultados de la electroforesis con la espectrometría de masas, la secuenciación y los ensayos funcionales. Los estudiantes diseñan flujos de trabajo de múltiples pasos donde la electroforesis sirve como paso preparativo o analítico.