Curso de Diagnóstico Molecular Clínico

Lección 1 • Estructura y Función de los Ácidos Nucleicos

Se examinan la estructura del ADN y ARN, el apareamiento de bases y la replicación. Esta base apoya la comprensión de todos los métodos posteriores de amplificación y detección.

Lección 2 • Biología Celular para Diagnóstico

Se revisan los compartimentos celulares y la localización de ácidos nucleicos. Los estudiantes conectan la función de los organelos con la toma de muestra y el rendimiento de ácidos nucleicos.

Lección 3 • Fundamentos de Genética y Genómica

Se introducen la herencia mendeliana, las mutaciones y la variación genómica. Estos conceptos sustentan la interpretación de los resultados de pruebas genéticas y de enfermedades infecciosas.

Lección 4 • Enzimas en Biología Molecular

Se describen las enzimas clave utilizadas en ensayos moleculares con sus mecanismos. Los estudiantes reconocen cómo las propiedades enzimáticas determinan las decisiones de diseño del ensayo.

Lección 1 • Plataformas de Extracción Automatizada

Se comparan los sistemas automatizados de manipulación de líquidos para extracción de ácidos nucleicos. Los estudiantes operan plataformas y reconocen los beneficios de la integración del flujo de trabajo en laboratorios de alto volumen.

Lección 2 • Cuantificación y Evaluación de Calidad de Ácidos Nucleicos

Se cubren métodos espectrofotométricos, fluorométricos y electroforéticos para evaluar la pureza y el rendimiento de ácidos nucleicos. Las métricas de calidad guían las decisiones sobre cómo proceder con los ensayos posteriores.

Lección 3 • Tipos de Muestra y Estándares de Toma

Se identifican los tipos de muestra apropiados para ensayos moleculares junto con los requisitos de toma. Una toma adecuada previene directamente errores preanalíticos que comprometen los resultados.

Lección 4 • Principios de Extracción de Ácidos Nucleicos

Se explican los principios químicos y físicos de la lisis celular y la purificación de ácidos nucleicos. Los estudiantes seleccionan métodos de extracción según el tipo de muestra y las necesidades del ensayo posterior.

Lección 1 • Fundamentos de la Reacción en Cadena de la Polimerasa

Se examinan en detalle los pasos del termociclado de PCR, el diseño de cebadores y los componentes de la reacción. El dominio de la mecánica de la PCR es prerrequisito para todos los métodos avanzados de amplificación.

Lección 2 • PCR con Transcriptasa Inversa

Se detalla la conversión de ARN a ADNc y la amplificación posterior para la detección de objetivos de ARN. Los estudiantes aplican RT-PCR al diagnóstico de virus respiratorios y expresión génica.

Lección 3 • PCR Múltiple y Diseño de Paneles

Se aborda la amplificación simultánea de múltiples objetivos en una sola reacción. Los estudiantes equilibran la compatibilidad de cebadores, sensibilidad y utilidad clínica en la construcción de paneles.

Lección 4 • Métodos de Amplificación Isotérmica

Se presentan LAMP, NASBA y SDA como alternativas a la amplificación basada en termociclado. Los estudiantes evalúan los métodos isotérmicos para entornos de punto de atención y recursos limitados.

Lección 1 • Genotipificación Basada en Microarreglos

Se introducen las plataformas de microarreglos de ADN para la genotipificación simultánea de miles de variantes. Los estudiantes evalúan datos de arreglos para tipificación de patógenos y paneles farmacogenómicos.

Lección 2 • Detección Basada en Hibridación

Se cubren los principios y formatos de hibridación de sondas, incluyendo Southern blot y ensayos con sonda en línea. Los estudiantes aplican métodos de hibridación a la identificación de patógenos y detección de resistencia.

Lección 3 • Secuenciación Sanger para Uso Clínico

Se explica la secuenciación por terminación de cadena con didesoxinucleótidos y la electroforesis capilar para la identificación de variantes. Los estudiantes interpretan electroferogramas e identifican mutaciones clínicamente significativas.

Lección 4 • Análisis de Curva de Fusión y Alta Resolución

Se detalla el análisis de curva de fusión post-PCR para genotipificación y tamizaje de mutaciones. Los estudiantes distinguen alelos silvestres de mutantes usando perfiles de temperatura de fusión.

Lección 1 • Estrategias de Enriquecimiento Dirigido

Se comparan los métodos de enriquecimiento basados en amplicones y captura por hibridación para secuenciación dirigida. Los estudiantes diseñan paneles que apuntan a genes clínicamente accionables o genomas de patógenos.

Lección 2 • Plataformas y Químicas de Secuenciación

Se comparan las plataformas Illumina, Ion Torrent y de lectura larga por química, longitud de lectura y perfil de error. Los estudiantes seleccionan plataformas según los requisitos de la aplicación clínica.

Lección 3 • Preparación de Bibliotecas NGS

Se detallan los pasos de fragmentación del ADN, reparación de extremos, ligación de adaptadores y amplificación para la construcción de bibliotecas NGS. La calidad de la biblioteca determina directamente la profundidad de secuenciación y la confiabilidad de los datos.

Lección 4 • Interpretación Clínica de Resultados de NGS

Se aplican marcos de clasificación de variantes y estándares de reporte para NGS clínica. Los estudiantes distinguen variantes patogénicas de benignas utilizando criterios de clasificación basados en evidencia.

Lección 1 • Genotipificación de Resistencia Antimicrobiana

Se enseña la detección molecular de genes y mutaciones de resistencia para apoyo rápido a decisiones clínicas. Los estudiantes identifican marcadores de SARM, carbapenemasas y resistencia antiviral.

Lección 2 • Detección de Patógenos Bacterianos

Se cubren los métodos de PCR y secuenciación para la detección e identificación bacteriana directa a partir de muestras clínicas. Los estudiantes aplican métodos moleculares cuando el cultivo es lento o impráctico.

Lección 3 • Ensayos de Carga Viral y Genotipificación

Se detallan las pruebas cuantitativas de carga viral y genotipificación para VIH, VHC, VHB y CMV. Los estudiantes usan los datos de carga viral para guiar la terapia antiviral y monitorear la respuesta al tratamiento.

Lección 4 • Paneles de Patógenos Respiratorios

Se examinan paneles múltiples sindrómicos para virus respiratorios y bacterias atípicas. Los estudiantes interpretan los resultados del panel en el contexto de la presentación clínica y epidemiológica.

Lección 1 • Inestabilidad de Microsatélites y Pruebas de MMR

Se detallan las pruebas de MSI basadas en PCR y la correlación con IHC para deficiencia de reparación de mal apareamiento. Los estudiantes aplican el estado de MSI para elegibilidad de inmunoterapia y tamizaje de síndrome de Lynch.

Lección 2 • Detección de Fusiones Génicas y Translocaciones

Se enseñan métodos de FISH, RT-PCR y NGS para detectar translocaciones cromosómicas y fusiones génicas. Los estudiantes identifican fusiones clínicamente accionables en tumores hematológicos y sólidos.

Lección 3 • Análisis de Mutaciones Somáticas

Se cubre la detección de mutaciones somáticas en oncogenes y supresores tumorales usando PCR y NGS. Los estudiantes vinculan mutaciones específicas con la elegibilidad para terapia dirigida y pronóstico.

Lección 4 • Pruebas Moleculares en Neoplasias Hematológicas

Se cubren los marcadores moleculares para diagnóstico y monitoreo de leucemia, linfoma y mieloma. Los estudiantes aplican ensayos de clonalidad y pruebas de MRD al manejo de enfermedades hematológicas.

Lección 1 • Prevención y Control de Contaminación

Se identifican las fuentes de contaminación por amplicones y muestras en laboratorios moleculares con estrategias de prevención. Los estudiantes diseñan controles físicos y de procedimiento para eliminar resultados falsos positivos.

Lección 2 • Pruebas de Aptitud y Evaluación Externa de Calidad

Se explican los programas externos de pruebas de aptitud y su papel en la acreditación de laboratorios. Los estudiantes se inscriben en programas de PA, analizan resultados e implementan acciones correctivas.

Lección 3 • Diseño y Monitoreo de Control de Calidad

Se aplican materiales de CC internos, gráficas de Levey-Jennings y reglas de Westgard al monitoreo de ensayos moleculares. Los estudiantes detectan y responden a fallas de CC antes de liberar los resultados del paciente.

Lección 4 • Cumplimiento Regulatorio y Acreditación

Se revisan los estándares de acreditación de laboratorios, las calificaciones del personal y los requisitos de documentación para laboratorios moleculares. Los estudiantes se preparan para la preparación de inspecciones y mantienen registros de cumplimiento.