Curso de Microbiomas Forenses

Lección 1 • Historia de la Microbiología Forense

Recorre casos emblemáticos donde la prueba microbiana moldeó las investigaciones. Demuestra la evolución de la disciplina desde el uso anecdótico hasta una ciencia sistemática.

Lección 2 • Valor Probatorio de los Datos Microbianos

Explica cómo los perfiles microbianos funcionan como prueba de trazas. Los estudiantes evalúan los criterios de admisibilidad y el concepto de unicidad microbiana.

Lección 3 • Definiendo el Microbioma Humano

Introduce las comunidades microbianas y su composición específicas para cada sitio del cuerpo. Conecta el conocimiento del microbioma basal con la detección de desviaciones en escenarios forenses.

Lección 1 • Contaminación y Control de la Escena

Identifica las fuentes de contaminación que comprometen la integridad de la prueba microbiana. Introduce estrategias de muestreo de control para distinguir los microbiomas de la escena de los contaminantes.

Lección 2 • Dinámicas Temporales en la Escena del Delito

Describe cómo las comunidades microbianas cambian con el tiempo después de un incidente. Los estudiantes usan patrones de sucesión para estimar el tiempo transcurrido desde el evento.

Lección 3 • Geolocalización Usando Microbiomas Ambientales

Explora las firmas geográficas incrustadas en los perfiles microbianos ambientales. Los estudiantes vinculan los datos microbianos con las ubicaciones de origen probables de la prueba.

Lección 4 • Transferencia y Persistencia Microbiana

Analiza cómo los microbios se mueven entre hospedadores, objetos y superficies. Explica los factores de persistencia críticos para interpretar la prueba de contacto.

Lección 1 • Herramientas y Técnicas de Recolección

Presenta hisopos, biopsias, recolección a granel y dispositivos de muestreo de aire. Los estudiantes relacionan el método de recolección con el tipo de prueba y el sustrato.

Lección 2 • Seguridad en Campo y Protocolos de Riesgo Biológico

Aborda el equipo de protección personal y los procedimientos de descontaminación en la escena. Asegura que los estudiantes se protejan a sí mismos y a la prueba de manera simultánea.

Lección 3 • Aseguramiento de la Calidad en la Recolección de Muestras

Presenta las métricas de QA, los espacios en blanco de campo y el muestreo por duplicado para validar la calidad de la recolección. Vincula las prácticas de QA con la fiabilidad analítica posterior.

Lección 4 • Diseño de la Estrategia de Muestreo

Cubre los enfoques sistemáticos para seleccionar las ubicaciones y cantidades de muestreo. Conecta la teoría del muestreo estadístico con la logística práctica de la escena del delito.

Lección 1 • Secuenciación de Amplicones del Gen 16S rRNA

Cubre la selección de cebadores, amplificación por PCR y preparación de bibliotecas para el perfilado del 16S. Los estudiantes aplican este método para caracterizar la composición de la comunidad bacteriana.

Lección 2 • Secuenciación Metagenómica por Escopeta

Presenta la secuenciación de comunidades completas para el perfilado taxonómico y funcional. Los estudiantes comparan las aproximaciones de metagenómica y amplicones para aplicaciones forenses.

Lección 3 • Principios de la Extracción de ADN Microbiano

Explica las estrategias de lisis celular, remoción de inhibidores y optimización del rendimiento para matrices complejas. Prepara a los estudiantes para solucionar fallas en la extracción en muestras forenses.

Lección 4 • Manejo de ADN Degradado y Trazas

Aborda las estrategias de amplificación y secuenciación para muestras dañadas o de cantidad mínima. Directamente relevante para casos de prueba antigua y escenarios de degradación ambiental.

Lección 1 • Flujos de Clasificación Taxonómica

Presenta la agrupación de OTU, la eliminación de ruido de ASV y la alineación con bases de datos de referencia. Los estudiantes asignan taxonomía a las lecturas microbianas con confianza cuantificada.

Lección 2 • Reproducibilidad y Validación del Flujo de Trabajo

Aborda el control de versiones, la contenerización y la evaluación comparativa para la bioinformática forense. Asegura que los resultados analíticos resistan el escrutinio legal y científico.

Lección 3 • Control de Calidad de Datos Crudos

Cubre la evaluación de calidad de lectura, el recorte de adaptadores y los flujos de filtrado. Establece la integridad de los datos antes de cualquier análisis taxonómico o funcional posterior.

Lección 4 • Anotación Funcional del Metagenoma

Cubre la predicción de genes, el mapeo de rutas y la reconstrucción metabólica a partir de datos metagenómicos. Conecta los perfiles funcionales con la inferencia forense sobre las condiciones de la escena.

Lección 1 • Estimación del Tiempo Transcurrido desde el Evento

Aplica modelos de sucesión y descomposición microbiana para estimar el momento del evento. Los estudiantes integran múltiples indicadores microbianos para una inferencia temporal más precisa.

Lección 2 • Métodos de Atribución de Origen

Cubre los algoritmos de rastreo de fuentes microbianas y los enfoques de identificación individual. Los estudiantes atribuyen las muestras de prueba a probables fuentes humanas o ambientales.

Lección 3 • Marcos de Interpretación Probabilística

Introduce las razones de verosimilitud y el razonamiento bayesiano para la evaluación de la prueba microbiana. Los estudiantes calculan y comunican el peso de la prueba microbiana de manera objetiva.

Lección 4 • Construcción y Uso de Bases de Datos de Referencia

Explica cómo las bases de datos curadas de microbiomas de referencia permiten el análisis forense comparativo. Los estudiantes evalúan la completitud y el sesgo de la base de datos para su contexto investigativo.

Lección 1 • Investigaciones de Delitos Ambientales

Aplica la prueba microbiana a casos de vertido ilegal, contaminación y tráfico de vida silvestre. Los estudiantes vinculan la alteración del microbioma ambiental con actividades delictivas específicas.

Lección 2 • Casos de Homicidio e Investigación de Muertes

Aplica el análisis del microbioma a la estimación del intervalo post mortem y la reconstrucción de la escena. Los estudiantes realizan ejercicios de interpretación de prueba basada en la descomposición.

Lección 3 • Análisis de Prueba en Agresión Sexual

Cubre los enfoques basados en microbiomas para la identificación de fluidos corporales y prueba de contacto. Los estudiantes manejan prueba sensible con el cuidado ético y procesal apropiado.

Lección 4 • Bioterrorismo y Atribución de Patógenos

Examina la microbiología forense en investigaciones de liberación deliberada y bioterrorismo. Los estudiantes aplican la secuenciación del genoma completo y la filogenética para atribuir las fuentes de patógenos.

Lección 1 • Redacción de Informes de Microbioma Forense

Cubre la estructura, el lenguaje y los estándares de contenido para informes periciales forenses. Los estudiantes redactan informes que son técnicamente precisos y accesibles para las audiencias legales.

Lección 2 • Estándares Científicos para la Admisibilidad de la Prueba

Revisa los criterios de aceptación general, revisión por pares y tasa de error aplicados a métodos forenses novedosos. Los estudiantes evalúan si sus métodos microbianos cumplen con los umbrales de admisibilidad.

Lección 3 • Interrogatorio directo, el contrainterrogatorio y la preparación para declaraciones

Capacita a los estudiantes en el interrogatorio directo, el contrainterrogatorio y la preparación para declaraciones. Desarrolla la confianza para defender la metodología de prueba microbiológica bajo interrogatorio adversarial.

Lección 4 • Impugnación del Testimonio Pericial Contrario

Capacita a los estudiantes para evaluar críticamente las afirmaciones contrarias sobre la prueba microbiana en contextos legales. Los estudiantes identifican fallas metodológicas y articulan refutaciones con claridad.