Cours évolution

Leçon 1 • Histoire de la pensée évolutionniste

Retrace les idées des naturalistes prédarwiniens jusqu'à la synthèse moderne. Offre un contexte historique qui explique la structure actuelle de la théorie.

Leçon 2 • Définir l'évolution et sa portée

Définit l'évolution comme un changement des fréquences alléliques dans le temps et distingue la microévolution de la macroévolution. Ancre tous les chapitres suivants à une définition de travail précise.

Leçon 3 • Aperçu des mécanismes fondamentaux

Présente les quatre grandes forces évolutives : la mutation, le flux génique, la dérive génétique et la sélection naturelle. Prépare le terrain pour un traitement plus approfondi dans les chapitres suivants.

Leçon 1 • Principes de l'hérédité mendélienne

Couvre la ségrégation, l'assortiment indépendant et les relations de dominance. Fournit les règles de l'hérédité que la génétique des populations met à l'échelle.

Leçon 2 • Équilibre de Hardy-Weinberg

Dérive le principe de Hardy-Weinberg et ses cinq hypothèses. Sert de modèle nul par rapport auquel le changement évolutif est mesuré.

Leçon 3 • Notions de base en génétique quantitative

Présente l'héritabilité, les traits polygéniques et l'équation de l'éleveur. Relie l'architecture génétique au taux et à la direction de la réponse évolutive.

Leçon 4 • Base moléculaire de l'hérédité

Explique la structure de l'ADN, la réplication et l'expression génique comme sources de variation héréditaire. Relie les processus moléculaires aux résultats phénotypiques pertinents pour la sélection.

Leçon 1 • Sélection sexuelle

Distingue la compétition intrasexuelle du choix intersexuel et leurs conséquences évolutives. Explique les traits élaborés qui réduisent la survie mais augmentent le succès reproducteur.

Leçon 2 • Sélection dépendante de la fréquence et sélection de parentèle

Couvre la sélection négative dépendante de la fréquence et la règle de Hamilton pour la sélection de parentèle. Élargit la sélection au-delà de la valeur adaptative individuelle à la valeur adaptative inclusive.

Leçon 3 • Principes de la sélection naturelle

Formalise les trois conditions de Darwin : la variation, l'héritabilité et la valeur adaptative différentielle. Établit la structure logique qui sous-tend tous les modèles de sélection.

Leçon 4 • Sélection directionnelle, stabilisatrice et disruptive

Oppose les trois modes de sélection classiques à l'aide de diagrammes de distribution de traits. Les étudiants et étudiantes prédisent quel mode est à l'œuvre selon le contexte écologique.

Leçon 1 • Détection de la dérive par rapport à la sélection

Présente des tests statistiques tels que le D de Tajima et les rapports dN/dS pour distinguer la dérive de la sélection. Applique ces outils à des ensembles de données génomiques réels.

Leçon 2 • Mécanismes de la dérive génétique

Explique l'erreur d'échantillonnage aléatoire dans les populations finies et son effet sur les fréquences alléliques. Établit la dérive comme une force distincte de la sélection et parfois opposée à celle-ci.

Leçon 3 • Théorie neutre de l'évolution moléculaire

Présente la théorie neutre de Kimura et le concept d'horloge moléculaire. Fournit le cadre d'interprétation des taux de substitution synonymes et non synonymes.

Leçon 1 • Concepts de subdivision de la population

Définit les dèmes, les métapopulations et les modèles d'isolement par la distance. Encadre comment la géographie et la dispersion créent une structure génétique.

Leçon 2 • Flux génique et ses effets évolutifs

Examine comment la migration homogénéise les fréquences alléliques et contrecarre l'adaptation locale. Quantifie l'équilibre entre la dérive et le flux génique.

Leçon 3 • Mesure de la différenciation génétique

Couvre le FST et les statistiques connexes pour quantifier la divergence entre populations. Relie les métriques de différenciation aux applications en évolution et en conservation.

Leçon 4 • Métissage et hybridation

Explore les conséquences génétiques du contact secondaire entre populations divergentes. Présente la cartographie du métissage et l'analyse des zones hybrides.

Leçon 1 • Taux de spéciation et macroévolution

Relie les processus microévolutifs aux schémas de diversification à grande échelle. Présente les concepts de radiation adaptative et de sélection d'espèces.

Leçon 2 • Mécanismes d'isolement prézygotique et postzygotique

Catalogue les barrières qui empêchent l'accouplement ou réduisent la valeur adaptative hybride. Distingue l'isolement primaire de l'isolement secondaire et leurs contributions relatives.

Leçon 3 • Spéciation allopatrique et parapatrique

Oppose la divergence causée par l'isolement géographique à la spéciation sur une aire de répartition continue. Identifie les conditions favorisant chaque mode.

Leçon 4 • Concepts et définitions d'espèce

Compare les concepts d'espèce biologique, phylogénétique, écologique et morphologique. Clarifie pourquoi le choix du concept affecte la façon dont la spéciation est étudiée et mesurée.

Leçon 1 • Méthodes de reconstruction phylogénétique

Couvre les méthodes de parcimonie, basées sur la distance, de maximum de vraisemblance et bayésiennes. Compare les hypothèses et les cas d'utilisation appropriés pour chaque approche.

Leçon 2 • Horloges moléculaires et datation des divergences

Applique des horloges moléculaires calibrées par taux pour estimer les temps de divergence. Relie les points de calibration fossiles aux phylogénies moléculaires.

Leçon 3 • Lire et construire des arbres phylogénétiques

Présente la topologie de l'arbre, les nœuds, les branches et les concepts de clade. Assure que les étudiants et étudiantes peuvent extraire des informations évolutives correctes de tout diagramme d'arbre.

Leçon 4 • Extinctions massives et radiations évolutives

Examine comment les événements d'extinction réinitialisent les opportunités écologiques et déclenchent la diversification. Relie les schémas d'extinction aux radiations adaptatives ultérieures.

Leçon 1 • Évolution de la résistance aux antibiotiques

Applique la sélection, la mutation et le flux génique à l'émergence d'agents pathogènes résistants aux médicaments. Tire des stratégies de gestion des principes évolutifs.

Leçon 2 • Biologie de la conservation et évolutionniste

Intègre les principes évolutifs dans la conservation de la biodiversité, y compris le potentiel évolutif et l'évolution assistée. Fait le pont entre la théorie et la pratique de la conservation.

Leçon 3 • Synthèse de la pensée évolutionniste

Revient sur la synthèse évolutive étendue et les questions ouvertes dans le domaine. Prépare les étudiants et étudiantes à s'engager dans la recherche actuelle et les débats émergents.

Leçon 4 • Médecine évolutionniste

Recadre la maladie humaine à travers le prisme de l'évolution, y compris l'inadéquation, les compromis d'histoire de vie et la coévolution hôte-pathogène. Génère des hypothèses cliniques novatrices.