Curso de Microbioma Intestinal e Disbiose

Aula 1 • Principais Taxa Microbianos do Intestino

Apresenta os filos bacterianos dominantes, as archaea, os fungos e os vírus que habitam o intestino. Fornece o contexto taxonómico para discussões funcionais posteriores.

Aula 2 • Fatores que Moldam a Composição do Microbioma

Identifica a genética do hospedeiro, a dieta, a idade e o ambiente como os principais moduladores da estrutura do microbioma. Prepara o terreno para os capítulos sobre disbiose e doença.

Aula 3 • Anatomia Intestinal e Nichos Microbianos

Mapeia a distribuição microbiana ao longo dos segmentos intestinais, desde o estômago até ao cólon. Explica como a anatomia molda a composição da comunidade.

Aula 4 • Princípios Ecológicos no Intestino

Aplica conceitos ecológicos — diversidade, resiliência e sucessão — às comunidades microbianas intestinais. Enquadra a estabilidade do microbioma como uma propriedade ecológica.

Aula 1 • Pipelines de Bioinformática e Bases de Dados

Guia os estudantes através dos fluxos de trabalho padrão de bioinformática e das bases de dados de referência para a análise do microbioma. Enfatiza a reprodutibilidade e o controlo de qualidade.

Aula 2 • Modelos Animais Isentos de Germes e Gnotobióticos

Descreve os modelos isentos de germes e gnotobióticos usados para estabelecer relações causais entre o microbioma e o hospedeiro. Ponteia as descobertas in vitro com evidências mecanicistas in vivo.

Aula 3 • Recolha e Processamento de Amostras

Abrange protocolos de recolha de fezes e biópsias, condições de armazenamento e extração de ADN. O manuseamento adequado é pré-requisito para uma análise a jusante válida.

Aula 4 • Sequenciação do Gene ARNr 16S

Explica a perfilagem baseada em amplicões das comunidades bacterianas usando o gene marcador ARNr 16S. Conecta o fluxo de trabalho de sequenciação aos resultados da classificação taxonómica.

Aula 5 • Metagenómica Shotgun

Apresenta a sequenciação do genoma completo de comunidades microbianas para resolução funcional e taxonómica. Contrasta com a sequenciação do gene 16S em termos de âmbito e profundidade analítica.

Aula 1 • Microbioma e Desenvolvimento do Sistema Imunitário

Explica como os micróbios comensais educam a imunidade inata e adaptativa desde o início da vida. Relaciona os sinais microbianos com a tolerância imunitária e a inflamação.

Aula 2 • Interações do Microbioma com o Metabolismo de Fármacos

Examina como os micróbios intestinais biotransformam produtos farmacêuticos, afetando a eficácia e a toxicidade dos fármacos. Introduz a farmacomicrobiómica como um campo clinicamente relevante.

Aula 3 • O Eixo Intestino-Cérebro

Descreve as vias neurais, endócrinas e imunitárias que ligam os micróbios intestinais à função e ao comportamento cerebral. Estabelece a base mecanicista para as conexões entre o microbioma e a saúde mental.

Aula 4 • Estrutura e Função da Barreira Intestinal

Abrange as junções apertadas do epitélio, as camadas de muco e os péptidos antimicrobianos como a interface entre os micróbios e o hospedeiro. A integridade da barreira é fundamental para discussões posteriores sobre doenças.

Aula 1 • Disfunção da Barreira e Intestino Permeável

Explica como a disbiose compromete a integridade da barreira intestinal, permitindo a translocação microbiana. Relaciona a falha da barreira com a inflamação sistémica.

Aula 2 • Definir e Medir a Disbiose

Estabelece definições operacionais de disbiose e critérios para a distinguir da variação normal. Introduz índices quantitativos usados em contextos de investigação e clínicos.

Aula 3 • Consequências Metabólicas da Disbiose

Conecta perfis de microbioma disbiótico à produção alterada de metabolitos que afetam o metabolismo do hospedeiro. Fornece ligações mecanicistas à obesidade e síndrome metabólica.

Aula 4 • Desregulação Imunitária Decorrente da Disbiose

Detalha como as comunidades disbióticas desviam as respostas imunitárias para a inflamação crónica ou supressão imunitária. Ponteia a disbiose ao risco de doenças autoimunes e alérgicas.

Aula 1 • Síndrome do Intestino Irritável e Microbiota Intestinal

Examina a composição e função do microbioma nos subtipos de SCI e na SCI pós-infeciosa. Relaciona as alterações microbianas com a hipersensibilidade visceral e alterações da motilidade.

Aula 2 • Cancro Colorretal e Oncogénese Microbiana

Identifica bactérias pro-oncogénicas e mecanismos microbianos que impulsionam a carcinogénese colorretal. Avalia biomarcadores baseados no microbioma para a deteção do cancro.

Aula 3 • Infeção por Clostridioides difficile

Analisa como a disbiose induzida por antibióticos permite a colonização por C. difficile e a colite mediada por toxinas. Estabelece a lógica para estratégias de tratamento baseadas no microbioma.

Aula 4 • Doença Inflamatória Intestinal e o Microbioma

Perfila as alterações do microbioma na doença de Crohn e na colite ulcerosa e o seu papel na inflamação da mucosa. Conecta a disbiose à patogénese da DII e aos ciclos de surtos.

Aula 1 • Obesidade, Diabetes e o Microbioma Intestinal

Examina as diferenças do microbioma em indivíduos obesos e diabéticos e as evidências causais de modelos animais. Relaciona os metabolitos microbianos com a resistência à insulina e adipogénese.

Aula 2 • Doença Cardiovascular e Metabolitos Microbianos

Foca-se no TMAO, ácidos biliares e ácidos gordos de cadeia curta como mediadores microbianos do risco cardiovascular. Avalia evidências epidemiológicas e mecanicistas.

Aula 3 • Alergia, Asma e a Hipótese da Higiene

Conecta a redução da diversidade microbiana no início da vida ao aumento do risco de doença atópica através da hipótese da higiene. Revê o modo de nascimento e a exposição a antibióticos como moduladores chave.

Aula 4 • Doenças Autoimunes e Desencadeadores Microbianos

Investiga as alterações do microbioma na artrite reumatoide, esclerose múltipla e diabetes tipo 1. Explora o mimetismo molecular e os mecanismos de reatividade cruzada imunitária.

Aula 1 • Prebióticos e Simbióticos

Abrange os substratos alimentares que estimulam seletivamente os micróbios benéficos e a sua combinação com probióticos. Avalia os tipos de fibra e os seus efeitos diferenciais no microbioma.

Aula 2 • Transplante de Microbiota Fecal

Explica a lógica do TMF, a seleção de dadores, os métodos de administração e os resultados clínicos. Aborda a segurança, considerações regulamentares e esforços de normalização emergentes.

Aula 3 • Probióticos de Próxima Geração e Pós-bióticos

Apresenta bioterapêuticos vivos modificados, estirpes probióticas de próxima geração e preparações de metabolitos pós-bióticos. Avalia o seu potencial terapêutico e desafios de desenvolvimento.

Aula 4 • Antibióticos e Estratégias Poupança de Microbioma

Examina os danos no microbioma induzidos por antibióticos e estratégias para minimizar a perturbação colateral. Introduz agentes de espetro estreito e co-intervenções de proteção do microbioma.

Aula 5 • Intervenções Dietéticas e Remodelação do Microbioma

Avalia como padrões dietéticos específicos remodelam o microbioma e os resultados de saúde a jusante. Compara estratégias dietéticas baseadas em plantas, mediterrânica e rica em fibras.

Aula 1 • Testes de Microbioma em Contextos Clínicos

Avalia criticamente os serviços de teste de microbioma diretos ao consumidor e clínicos quanto à precisão e utilidade. Orienta os profissionais na interpretação e comunicação dos resultados dos testes.

Aula 2 • Integrar a Ciência do Microbioma no Cuidado ao Doente

Sintetiza o conhecimento do microbioma em fluxos de trabalho clínicos práticos para condições gastrointestinais, metabólicas e de saúde mental. Aborda a colaboração interdisciplinar e a comunicação com o doente.

Aula 3 • Microbioma e Resposta à Imunoterapia do Cancro

Examina como a composição do microbioma intestinal influencia a resposta à terapia com inibidores de checkpoint imunitário. Identifica alvos microbianos acionáveis para melhorar os resultados da imunoterapia.

Aula 4 • Nutrição Personalizada e o Microbioma

Aplica a perfilagem do microbioma para individualizar recomendações dietéticas para além das diretrizes populacionais. Revê a variabilidade da resposta glicémica como modelo para a nutrição de precisão.