Curso de Electroforesis

Lección 1 • Variables clave que afectan la separación

Identifica el voltaje, la temperatura, el pH y la composición de la muestra como parámetros críticos. Los estudiantes aprenden a predecir cómo el cambio de cada variable modifica los patrones de migración.

Lección 2 • Desarrollo histórico y aplicaciones

Traza la evolución de la electroforesis desde los primeros estudios de proteínas séricas hasta la genómica moderna. Contextualiza la evolución de la técnica y motiva los capítulos técnicos posteriores.

Lección 3 • Principios de la migración de moléculas cargadas

Cubre la carga iónica, las interacciones con el campo eléctrico y los conceptos de carga neta. Conecta la electroquímica fundamental con el porqué las moléculas se mueven en una matriz de gel o solución.

Lección 1 • Sistemas de gel especiales y modificados

Introduce los geles en gradiente, los geles desnaturalizantes y la agarosa de bajo punto de fusión. Amplía el conjunto de herramientas del estudiante para separaciones complejas encontradas en capítulos posteriores.

Lección 2 • Sistemas tampón y sus funciones

Compara los tampones TAE, TBE, MOPS, Tris-glicina y MES por su rango de tamponamiento y fuerza iónica. Los estudiantes adecuan la elección del tampón al tipo de analito y a las aplicaciones posteriores.

Lección 3 • Química del gel de poliacrilamida

Explica la polimerización de acrilamida y bis-acrilamida, la densidad de entrecruzamiento y la notación %T/%C. Prepara a los estudiantes para formular geles para separaciones de proteínas y ácidos nucleicos pequeños.

Lección 1 • Marcadores de peso molecular y escaleras

Explica la composición de las escaleras, el dimensionamiento de fragmentos y las cantidades de carga adecuadas. La estimación precisa del tamaño depende de la selección correcta del marcador y la colocación en el carril.

Lección 2 • Resolución de problemas comunes en geles

Identifica las causas de barridos, carriles distorsionados, bandas tenues y fluorescencia de fondo. Las habilidades sistemáticas de resolución de problemas se transfieren a todas las técnicas basadas en gel en capítulos posteriores.

Lección 3 • Tinción, visualización y documentación

Compara los métodos de tinción con bromuro de etidio, SYBR Safe y GelRed y la obtención de imágenes con luz UV/azul. Los estudiantes seleccionan protocolos de tinción seguros y sensibles y documentan los resultados adecuadamente.

Lección 4 • Preparación de muestras para ácidos nucleicos

Cubre la cuantificación de ADN y ARN, la composición del tampón de carga y la desnaturalización para ARN. Una preparación adecuada previene los barridos y asegura una migración reproducible.

Lección 1 • Formulación de geles para SDS-PAGE

Cubre la composición del gel concentrador y separador, los porcentajes de acrilamida y las opciones de gradiente. Los estudiantes formulan geles adecuados al rango de peso molecular de sus proteínas diana.

Lección 2 • Estimación del peso molecular y análisis de bandas

Utiliza escaleras de proteínas y regresión lineal en gráficos semilogarítmicos para estimar pesos moleculares. Los estudiantes interpretan patrones de bandas para evaluar la pureza, degradación y niveles de expresión.

Lección 3 • Ejecución de SDS-PAGE y tinción de proteínas

Guía a los estudiantes a través del montaje, las condiciones de electroforesis y la tinción con Coomassie o plata. Una ejecución adecuada produce bandas nítidas y bien resueltas adecuadas para análisis posteriores.

Lección 4 • Preparación de muestras de proteínas

Detalla los métodos de lisis, los ensayos de cuantificación de proteínas y la preparación del tampón de muestra. Una preparación coherente de la muestra es un requisito previo para obtener resultados reproducibles en SDS-PAGE.

Lección 1 • Sistemas de detección y generación de señales

Compara los métodos de detección por quimioluminiscencia ECL, fluorescencia y colorimetría. Los estudiantes seleccionan sistemas de detección según los requisitos de sensibilidad y la instrumentación disponible.

Lección 2 • Bloqueo e incubación de anticuerpos

Cubre los agentes de bloqueo, la optimización de la dilución del anticuerpo primario y la selección del anticuerpo secundario. Las condiciones adecuadas de bloqueo y anticuerpos minimizan el fondo y maximizan la especificidad de la señal.

Lección 3 • Transferencia de proteínas a membranas

Compara los sistemas de transferencia húmeda, semiseca y seca, y las membranas de PVDF frente a nitrocelulosa. La eficiencia de la transferencia determina directamente la sensibilidad de detección en los pasos posteriores.

Lección 4 • Análisis cuantitativo de western blot

Introduce los controles de carga, las estrategias de normalización y el software de densitometría. Los estudiantes producen datos cuantitativos estadísticamente válidos a partir de imágenes de western blot.

Lección 1 • Rehidratación de tiras IPG y protocolo IEF

Detalla los métodos de carga de muestra, las condiciones de rehidratación y los programas de incremento de voltaje en IEF. La ejecución correcta del protocolo previene el barrido horizontal y asegura un enfoque nítido.

Lección 2 • Principios de la PAGE nativa

Explica la separación por carga, tamaño y forma en condiciones no desnaturalizantes. Los estudiantes comprenden cuándo se prefiere la PAGE nativa sobre la SDS-PAGE para estudios funcionales.

Lección 3 • Fundamentos del enfoque isoeléctrico

Explica la formación del gradiente de pH, el enfoque de proteínas en su pI y los sistemas de anfolitos portadores frente a tiras IPG. El IEF resuelve proteínas que difieren en tan solo 0,01 unidades de pH.

Lección 4 • Electroforesis bidimensional en gel

Combina IEF y SDS-PAGE para resolver miles de proteínas por pI y peso molecular. Los estudiantes ejecutan flujos de trabajo de 2-DE e interpretan patrones complejos de puntos.

Lección 1 • Electroforesis capilar en gel para ácidos nucleicos

Aplica capilares rellenos de polímero al dimensionamiento de fragmentos de ADN y la evaluación de la calidad del ARN. La ECG sustituye los geles en placa por análisis automatizado, cuantitativo y de alto rendimiento.

Lección 2 • Electroforesis capilar de zona

Cubre los principios de separación por ECZ, la selección del tampón y los modos de inyección para moléculas pequeñas y proteínas. Los estudiantes desarrollan y validan métodos de ECZ para clases de analitos definidas.

Lección 3 • Instrumentación de electroforesis capilar

Describe las dimensiones del capilar, las fuentes de alimentación de alto voltaje, los detectores y los componentes del automuestreador. La familiaridad con el instrumento es un requisito previo para el desarrollo de métodos en secciones posteriores.

Lección 4 • Enfoque isoeléctrico capilar

Adapta los principios del IEF al formato capilar para la determinación del pI de proteínas y el perfil de isoformas. Los estudiantes comparan el cIEF con el IEF en gel en términos de resolución y rendimiento.

Lección 1 • Desarrollo y validación de métodos

Aplica los principios del diseño de experimentos para optimizar el porcentaje de gel, el tampón y las condiciones de electroforesis. Los parámetros de validación incluyen especificidad, linealidad, rango y reproducibilidad.

Lección 2 • Densitometría cuantitativa y análisis de imágenes

Cubre los ajustes de adquisición de imágenes, la sustracción de fondo y el análisis de perfiles de carril para una cuantificación precisa. Los estudiantes utilizan herramientas de software para extraer datos numéricos fiables de las imágenes de gel.

Lección 3 • Electroforesis en gel de campo pulsado

Explica los principios del campo eléctrico alternante que permiten la separación de ADN de megabases. Los estudiantes aplican PFGE a la tipificación microbiana y al análisis de genomas grandes.

Lección 4 • Integración con métodos analíticos posteriores

Conecta los resultados de la electroforesis con la espectrometría de masas, la secuenciación y los ensayos funcionales. Los estudiantes diseñan flujos de trabajo de múltiples pasos donde la electroforesis sirve como paso preparativo o analítico.